Het museum is ondergebracht in het Venetiaanse klooster van Sint Franciscus. Tijdens de Turkse bezetting van Kreta was het klooster de moskee van Yussuf Pasha. Enkele decennia geleden nog werd het gebouw gebruikt als bioscoop en er werden zelfs militaire voorraden opgeslagen. Sinds 1963 wordt het voormalige klooster gebruikt als onderkomen voor het Archeologische Museum van de stad. Naast de permanente collectie worden er regelmatig tijdelijke exposities georganiseerd. Tevens vinden er regelmatig muziekconcerten plaats.
Adres: Odos Chalidon, 25 Chaniá Tel: +30-28210-90334 Fax: +30-28210-94487